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Welcome

Welcome to ‘cicCartuja Phd Talks’ website, an initiative launched by the Scientific Research Centre Isla de la Cartuja (cicCartuja) PhD students. The aim of this project is to disseminate the different lines of research within the centre and, at the same time, to establish collaborative ties between students.

The talks will cover a variety of topics focusing on the areas of Chemistry, Biology or Physics, among others. Undoubtedly, this is an excellent way for the students to enrich their academic knowledge and demonstrate their abilities.

Organizers

IBVF: Manuel Mallén

mmallen(at)us(dot)es

ICMS: Miguel Anaya and Andrea Rubino

miguel.anaya(at)csic(dot)es      andrea.rubino(at)icmse(dot)csic(dot)es

IIQ: Juan José Moreno

juanj.moreno(at)iiq(dot)csic(dot)es

6 October 2017

Venue: Lecture Room (cicCartuja 2)

Lectures from 13:00 to 14:00 h

Networking and refreshments from 14:00 to 15:00 h

Manuel Brenes Álvarez

Manuel Brenes Álvarez

Proteínas redox alternativas en fotosíntesis

IBVF
Aproximaciones bioinformáticas para el estudio de RNAs regulatorios en cianobacterias
Las cianobacterias son microorganismos complejos con múltiples niveles de regulación génica, entre los que se encuentran la regulación post-transcripcional mediada por RNAs regulatorios. En nuestro grupo utilizamos una combinación de aproximaciones bioinformáticas y biología molecular para estudiar la regulación ejercida por este tipo de moléculas en la cianobacteria Nostoc sp. PCC 7120.
Victoria Garcilaso

Victoria Garcilaso

Química de Superficies y Catálisis

ICMS
Produccion de Biocombustibles a partir de Biomasa
Recientemente grupo de Química de Superficies y catálisis ha apostado por contribuir con sus estudios en el avance hacia modelos energéticos basados en biorecursos. En concreto, mi trabajo en el grupo se basa en el aprovechamiento de gases no convencionales para la producción de biocombustibles.
Marina Pérez

Marina Pérez

Organometallic Chemistry and Homogeneous Catalysis

IIQ
A trip through multiple metal-metal bonding. Dimolybdenum complexes containing a quadruple bond
One of the most relevant areas of research in Organometallic Chemistry since the last half of the past century is the study of the multiple bonding between transition metal atoms. In our group, we have been working in dimolybdenum complexes containing a quadruple M-M bond, studying their singular structure and reactivity.

20 October 2017

Venue: Small Lecture Room (cicCartuja 2)

Lectures from 13:00 to 14:00 h

Networking and refreshments from 14:00 to 15:00 h

Valle Ojeda

Valle Ojeda

Señalización Redox y Respuesta a Estrés Ambiental en Plantas

IBVF (paper of the month – September 2017)
Mecanismos de regulación redox en cloroplastos de plantas
Las plantas transforman la energía lumínica en energía química mediante la fotosíntesis, principal fuente de materia orgánica y oxígeno lo que la hace esencial para la vida en la Tierra. Este proceso implica transporte de electrones en presencia de oxígeno, por lo que inevitablemente genera especies reactivas de oxígeno (ROS). La regulación redox basada en intercambios disulfuro-ditiol juega un papel esencial para aliviar este estrés oxidativo y adaptarse a condiciones ambientales cambiantes. Tradicionalmente se ha considerado que la regulación redox del cloroplasto depende de ferredoxina reducida fotosintéticamente y, por tanto de luz, vía el sistema FTR-Trx. Nuestro grupo identificó una nueva vía, NTRC, que depende de NADPH. Nuestro objetivo actual es establecer los mecanismos moleculares que permiten la coordinación de los sistemas NTRC y FTR/Trx en la regulación redox del cloroplasto.
Francisco Rivero

Francisco Rivero

Biointeractómica

IIQ
Biointeractómica del Citocromo c en Muerte Celular Programada en Humanos
En nuestro grupo se aborda el proceso de Muerte Celular Programa desde una aproximación biofísica y celular. Dicho evento es esencial para el correcto desarrollo de los organismos multicelulares, así como para su mantenimiento en estadio adulto. Entre los actores principales se encuentra el Citocromo c, una hemoproteína mitocondrial que adquiere nuevos roles durante la Muerte Celular Programada formando el apoptosoma e interaccionando con diversas proteínas para regular y concertar el desmantelamiento celular.
Sergio Arévalo Díaz

Sergio Arévalo Díaz

Developmental Biology in Cyanobacteria

IBVF
Comunicación intercelular en cianobacterias filamentosas
Las cianobacterias son organismos caracterizados por llevar a cabo la fotosíntesis oxigénica, y muchas cianobacterias crecen formando filamentos de células. En algunas especies existe un proceso de diferenciación celular mediante el cual, a partir de las células vegetativas fijadoras de CO2, se producen células especializadas en la fijación del nitrógeno atmosférico denominadas heterocistos. Dada la segregación de las actividades de fijación de CO2 y N2, diferentes estructuras de comunicación intercelular permiten el intercambio de diferentes moléculas en las cianobacterias formadoras de heterocistos

3 November 2017

Venue: Lecture Room (cicCartuja 2)

Lectures from 13:00 to 14:00 h

Networking and refreshments from 14:00 to 15:00 h

Franco Nahuel Bandi

Franco Nahuel Bandi

Departamento de Microelectrónica analógica de señal mixta

Institute of Microelectronics

Single Photon Counting Techniques for Time of Flight Applications

Single photon detection techniques have allow the development of new applications in fields like telemetry, topography, high energy physics, bio-medicine, quantum computing, among others. For example, these techniques can be employed to the measurement of the distance from different objects in the scene to the sensor, to detect and measure the energy of subatomic particles or to fairly estimate fluorescence lifetimes for the visualization of biomolecules. The discovery of structures capable of single-photon detection in CMOS technology has introduced the development of smart image sensor chips for 3D imaging and CMOS silicon photomultipliers with on-chip pulse shaping, time and energy estimation. This talk will be focused on direct Time of Flight (TOF) techniques in CMOS technologies and their application on Positron Emission Tomography.

Diego Torres Romero

Diego Torres Romero

Regulación del metabolismo del almidón en plantas superiores

IBVF

Papel de la Fibrilina 4 en la defensa frente a estreses abióticos en la planta modelo Arabidopsis thaliana

Las fibrilinas son sus proteínas mayoritarias, suponiendo en torno al 50% de proteínas totales, y han sido muy poco caracterizadas. En mi grupo trabajamos con varias de estas fibrilinas, entre las que se encuentra FBN4, mi principal proteínas de estudio, cuya función permanece prácticamente desconocida.

Elena Romero Ben

Elena Romero Ben

Síntesis Asimétrica y Nanosistemas Funcionales

IIQ
Carbohydrate-Based Supramolecular Hydrogels for Biomedical ApplicationsHydrogels and more specifically supramolecular hydrogels have become one of the most popular platforms for three-dimensional mammalian cell culture and for drug delivery. However, fundamental parameters behind self-assembly into supramolecular hydrogels difficult the design of materials in which molecular modification would control nanoscale assembly that ultimately endow the system with specific function. In the present work we report on a rational design of photopolymerisable neoglycolipids that hierarchically self-organize into functional and biocompatible supramolecular hydrogels.

17 November 2017

Venue: Lecture Room (cicCartuja 2)

Lectures from 13:00 to 14:00 h

Networking and refreshments from 14:00 to 15:00 h

Alberto Rodríguez Gómez

Alberto Rodríguez Gómez

Materials and processes for energy and environment

ICMS (paper of the month – October 2017)
Identificación de carburo de cobalto como sitio catalítico para la deshidrogenación de etanol a acetaldehído
La reacción de reformado catalítico de bio-etanol con vapor de agua se ha convertido en una de las vías más atractivas para la obtención de hidrógeno como vector energético. La selectividad y estabilidad del proceso es uno de los puntos más importantes a tener en cuenta para su implementación a nivel industrial, y conocer el estado físico-químico del catalizador en condiciones de reacción es clave para entender y poder mejorar su comportamiento catalítico.
Antonio Di Maio

Antonio Di Maio

Glycosystems laboratory - Immunoshape ITN

IIQ
Carbohydrate multivalent systems to study biological interactionsMultivalency plays a major role in biological processes that involves protein–oligosaccharide recognition events.The application of Glyco-units on Multivalent scaffolds has generated Glycomimetics structures that have demostrated to be very useful tools to understand and in many case interfere these crucial biochemical events.
Victoria Esteso Carrizo

Victoria Esteso Carrizo

Grupo de Materiales Ópticos Multifuncionales (MOM)

ICMS
La fuerza de Casimir y el fenómeno de levitación en sistemas plano-paralelos.La fuerza de Casimir desempeña un importante rol en los dispositivos a nanoescala surgidos desde hace 30 años. Por eso, es especialmente interesante que esta fuerza sea repulsiva entre las piezas de estos sistemas para evitar la fricción y adhesión entre ellas y por tanto el mal funcionamiento de estos dispositivos. En esta charla describiré qué es la fuerza de Casimir y cómo, desde el grupo MOM, se trabaja para encontrar sistemas que presenten fuerzas de Casimir repulsiva. En particular, me centraré en describir el fenómeno de levitación que provoca esta fuerza repulsiva en sistemas plano-paralelos.

1 December 2017

Venue: Lecture Room (cicCartuja 2)

Lectures from 13:00 to 14:00 h

Networking and refreshments from 14:00 to 15:00 h

Carlos Vivo Vilches

Carlos Vivo Vilches

Unidad de Investigación en AMS

National Accelerators Center

Accelerator Mass Spectrometry: a multidisciplinary tool

AMS is a technique based of accelerator technology with allows the ultrasensitive measurement of long-lived radionuclides, such as carbon-14, calcium-41, or actinide elements. The sensitivity of the technique and the variety of nuclides measured allows the application of AMS for a disciplines as different as archeology, oceanography or nuclear waste characterization.

Pedro Domínguez

Pedro Domínguez

Glycosystems laboratory

IIQ
To be determined
Beatriz Sarrión Aceytuno

Beatriz Sarrión Aceytuno

Mecanoquímica y Reactividad de Materiales

ICMS
Uso de carbonatos naturales en sistemas de almacenamiento termoquímico
Cheap, efficient and non-toxic energy storage technologies are urgently needed to handle the exponentially rising penetration of intermittent renewable energies into the grid. This research explores the use of limestone and dolomite for energy storage in Concentrated Solar Power (CSP) plants by means of the Calcium Looping (CaL) process based on the multicycle carbonation/calcination of CaO.

15 December 2017

Venue: Lecture Room (cicCartuja 2)

Lectures from 13:00 to 14:00 h

Networking and refreshments from 14:00 to 15:00 h

To be determined

To be determined

To be determined

IBVF/ICMS/IIQ (paper of the month -November 2017)
To be determined
Nuria García Moncada

Nuria García Moncada

Química de Superficies y Catálisis

ICMS
Conductores Protónicos en catalizadores para la reacción de WGS
La reacción de WGS (CO + H2O –> CO2 + H2) constituye una etapa fundamental en el proceso de aprovechamiento del H2 como combustible. La reacción de WGS ocupa aproximadamente el 75 % de la instalación, por lo que la reducción de su reactor y/o el aumento de la velocidad de la reacción es determinante para su aplicabilidad en dispositivos móviles. Con este objetivo, hemos logrado alcanzar mejores rendimientos mediante la adición de conductores protónicos al sistema catalítico.
Lucía Arenas Alfonseca

Lucía Arenas Alfonseca

Metabolismo de cisteína y señalización

IBVF

Papel del cianuro en la formación de los pelos radicales de arabidopsis thaliana

En un intento por cambiar la tradicional visión del cianuro como molécula tóxica, mostraremos una serie de resultados que pretenden demostrar el papel del cianuro como molécula señalizadora en el proceso de formación del pelo radical en Arabidopsis thaliana. En Arabidopsis, el cianuro se produce en la biosíntesis del etileno y es detoxificado principalmente por la ß-cianoalanina sintasa mitocondrial, CAS-C1. Esta enzima juega un papel esencial en el mantenimiento de niveles bajos de cianuro para el correcto desarrollo del pelo radical.

12 January 2018

Venue: Lecture Room (cicCartuja 2)

Lectures from 13:00 to 14:00 h

Networking and refreshments from 14:00 to 15:00 h

To be determined

To be determined

To be determined

Cabimer/CNA/IMSE/EBD
To be determined
Mari Carmen Castell Capitán

Mari Carmen Castell Capitán

Proteínas redox alternativas en fotosíntesis

IBVF
Alternative redox proteins in photosynthesis
Las algas diatomeas contribuyen de forma muy significativa a la productividad fotosintética global, y son de explotación biotecnológica en piscifactorías, acuicultura y producción de biocombustibles y compuestos de interés. Las diatomeas carecen de la cuproproteína plastocianina como donador alternativo del citocromo c6 (una proteína de hierro) al fotosistema I, lo que aumenta sus requerimientos de hierro e influye en su menor capacidad de adaptación a los bajos niveles de hierro biodisponible existentes en amplias zonas de los océanos. Utilizando Phaeodactylum tricornutum como sistema modelo se plantea la construcción de una estirpe de diatomea más tolerante a la limitación de hierro, mediante la expresión en Phaeodactylum de una plastocianina mutada del alga verde Chlamydomonas, con vistas a un uso biotecnológico.
Francisco Javier Osuna

Francisco Javier Osuna

Materiales de Diseño para la Energía y Medioambiente

ICMS
Design silicates for environmental management
La contaminación ambiental ha ido creciendo en paralelo al desarrollo tecnológico, siendo un reto para la sociedad actual una actuación eficaz para la protección del medioambiente. Entre los diversos materiales empleados en la gestión de los agentes contaminantes destacan por su eficacia los minerales de la arcilla, actualmente los esfuerzos se centran en mejorar su eficacia y selectividad.

26 January 2018

Venue: Lecture Room (cicCartuja 2)

Lectures from 13:00 to 14:00 h

Networking and refreshments from 14:00 to 15:00 h

Alazne Díez

Alazne Díez

Departamento de Ecología de Humedales

Doñana Biological Station
¿A qué huelen las aves? Perfiles cromatográficos del olor e implicaciones en la atracción de mosquitos
El olor de un ave juega un papel fundamental para la atracción de los mosquitos. Factores como la especie, sexo o edad, incluso hábitat y dieta, pueden modificar la composición de las secreciones de la glándula uropigial, y con ello, su olor. Así, el papel de estas secreciones estaría relacionado con la atracción de los mosquitos, condicionando la transmisión de patógenos, como la malaria aviar.
Antonio Romero

Antonio Romero

Catálisis Asimétrica

IIQ
New methodologies for the synthesis of axially chiral heterobiaryls
The synthesis of axially chiral heterobiaryls is still an unsolved problem in Organic Chemistry since the direct asymmetric coupling is not easily affordable. For this reason, our group has developed a new strategy to solve this problem.
To be determined

To be determined

To be determined

IBVF/ICMS/IIQ (paper of the month – December 2017)
To be determined

9 February 2018

Venue: Lecture Room (cicCartuja 2)

Lectures from 13:00 to 14:00 h

Networking and refreshments from 14:00 to 15:00 h

To be determined

To be determined

To be determined

IBVF/ICMS/IIQ (paper of the month – January 2017)
To be determined
Noe Orozco

Noe Orozco

Nanotechnology on surfaces

ICMS
Papel del oxígeno en la reacción de homoacoplamiento Hay-Glaser sobre Ag(100) en vacío y en solución con partículas de Ag.
Se ha observado el papel esencial del oxígeno para permitir el acoplamiento Hay-Glaser de fenilacetileno catalizado heterogéneamente por Ag(100) mediante STM, experimentos catalíticos, fotoemisión sincrotrón y cálculos DFT. En ausencia de oxígeno co-adsorbido, el fenilacetileno formó capas densas bien ordenadas las cuales, con el incremento de temperatura, se desorbieron sin reaccionar. En contraste, aún a 120 K, la presencia de oxígeno condujo a la inmediata y completa alteración de la capa orgánica debido a la abstracción del hidrógeno acetilénico con la formación de una capa desordenada mixta compuesta por ‘radicales’ de fenilacetileno. A temperaturas más altas los ‘radicales’ de fenilacetileno experimentaron acoplamiento Hay-Glaser y formaron dominios altamente ordenados de difenildiacetileno que finalemente se desorbieron sin descoposición dejando la superficie metálica al descubierto. Los cálculos DFT han mostrado que mientras la abstracción del H es un proceso endotérmico, los átomos adsorbidos de oxígeno desencadenan el inicio de un camino de reacción exotérmico conduciendo a OH(a) + ‘radical’ de fenilacetileno, consistentes con las observaciones experimentales. Además, se encontró que en una disolución de fenilacetileno en noname y en presencia de O2, partículas de Ag catalizaban el acoplamiento Hay-Glaser con una alta selectividad. Una exclusión minuciosa del oxígeno del reactor suprimió fuertemente la reacción catalítica. Es interesante que demasiado oxígeno no condujo a una mayor actividad catalítica. Así, los estudios en vacío y los cálculos teóricos han mostrado el papel clave del oxígeno en el mecanismo de reacción, subsecuentemente confirmado por estudios catalíticos con partículas de Ag que demostraron que la presencia de oxígeno es una condición necesaria y suficiente para producir la reacción de acoplamiento. La relevancia de los estudios modelo para el entendimiento mecanicista de la reacción bajo condiciones prácticas de catálisis fue reafirmada.
Noelia de la Cruz

Noelia de la Cruz

Glycosystems Laboratory

IIQ
Design of multivalent nano-sized materials with several copies of carbohydrates that are involved in biological events
In nature, there are a lot of carbohydrate-protein interactions which mediate many crucial biological events. These interactions are characterized by a high selectivity but a low affinity which is compensated in Nature with a high multivalency. In our lab, the synthesis of several multivalent carbohydrate-decorated glycoconjugates are being carried out to target DC-SIGN. This receptor is a C-type lectin expressed on the surface of macrophages and immature dendritic cells.

23 February 2018

Venue: Lecture Room (cicCartuja 2)

Lectures from 13:00 to 14:00 h

Networking and refreshments from 14:00 to 15:00 h

Tania Neva

Tania Neva

Grupo de Química Bioorgánica y Supramolecular de Carbohidratos

IIQ
To be determined
Mariana Paladini San Martín

Mariana Paladini San Martín

Diseño de nanomateriales y microestructura

ICMS
Nuevos materiales catalíticos preparados por pulverización catódica para generar H2 mediante hidrólisis de borohidruro de sodio.
En esta charla se abordará el estudio de nuevos catalizadores basados en cobalto y preparados mediante pulverización catódica para la generación de hidrógeno mediante la reacción de hidrólisis de borohidruro de sodio.
A modo de introducción se expondrán las ventajas que posee el borohidruro de sodio como material para almacenar hidrógeno, la necesidad de utilizar un catalizador soportado para generar el hidrógeno almacenado mediante su reacción de hidrolisis, presentando los beneficios de utilizar la técnica de pulverización catódica para la preparación del catalizador necesario. Se llevará a cabo una explicación del fundamento de la técnica de deposición por pulverización catódica para la preparación de materiales soportados. Y por último, se concluirá con los resultados más relevantes obtenidos a lo largo de esta tesis doctoral donde se correlacionan los parámetros utilizados con esta técnica de deposición, con la caracterización química y microestructural, y las propiedades catalíticas de los catalizadores preparados.
Luis Heredia Martínez

Luis Heredia Martínez

TOR signaling in Chlamydomonas

IBVF
Regulación redox de la autofagia
La autofagia es un proceso catabólico por el cual las células eucariotas degradan su propio material intracelular (orgánulos, complejos proteicos u otros) mediante un sistema de tráfico de vesículas para regular y mantener la homeóstasis celular. En este proyecto estudiamos los distintos componentes de dicho sistema y su posible regulación.